La Facultad de Química participa a nivel institucional o a través de sus docentes en varios programas de posgrado.
El programa de PEDECIBA-Química está íntimamente relacionado a nuestros posgrados académicos, y es común que estos programas se cursen en simultáneo. Docentes de nuestra Facultad participan activamente de otros programas de posgrado de PEDECIBA, como la maestría en Bioinfomática y la maestría y doctorado en Ciencias Biológicas.
Docentes de Facultad de Química participan asimismo como tutores en otros programas de Posgrado de UdelaR, en áreas como Biotecnología, Ciencias Agrarias y Ciencia y Tecnología de los Alimentos.
