A continuación se listan las áreas en las que se desarrollan línteas de investigación por cada uno de los Departamentos Docentes e Institutos de la Facultad de Química.
| Departamento de Biociencias - DEPBIO |
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| Departamento de Bioquímica Clínica - BIOCLIN |
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| Departamento de Ciencia y Tecnologia de los Alimentos - CYTAL |
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| Departamento de Ciencias Farmacéuticas - CIENFAR |
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| Departamento Estrella Campos - DEC |
| Departamento de Experimentación y Teoría de la Materia y sus Aplicaciones - DETEMA |
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| Departamento de Química Orgánica - DQO |
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| Instituto Polo Tecnológico de Pando - IPTP |
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